潜伏到抗战胜利的程彭小组
1939年底，军统派遣到伪满洲国工作的高级特工人员程克祥、彭寿、彭盛木等人在途经上海时，接到密令，要他们打入汪伪集团从事秘密工作。程克祥等人通过上海帮会首领徐朗西的关系，投到周佛海、罗君强的门下。1940年3月30日汪伪政府在南京成立后，程克祥在罗君强任委员长的伪边疆委员会内任藏事处处长，彭寿则任该委员会的秘书。后来程克祥转任伪社会运动指导委员会的总务处处长，彭寿任伪财政委员会的常务委员。彭盛木则因精通日语，在伪财政部任参事，兼任周佛海的日语翻泽。他们利用其职务，结交汪伪政府军政官员，获取各种情报，传递给重庆军统。重庆军统内称程克祥等人为程彭小组。
1942年1月初，程彭小组的身份被汪伪特工侦破。程克祥等3人在严刑拷打下被迫承认了自己的真实身份。周佛海出于自身利益考虑，让人保释程克祥等3人，并恢复了他们的原来职务。彭盛木在获释后不久即死去，有说是受刑伤重死去，也有说是被日本特务机关派人毒死。程克祥、彭寿则被周佛海安排到上海工作。周佛海利用程克祥、彭寿的军统身份，与重庆军统戴笠建立了直接联系，以为自己留条后路。
1942年10月底，程克祥奉周佛海指示，携周佛海的亲笔信回到重庆，向戴笠报告了周佛海希望建立秘密电讯联系的要求。1943年5月3日程克祥携带戴笠的信回到南京，对周佛海进行劝导，希望他“戴罪立功”，并挑拨其与汪精卫的关系，分化汪伪政权。军统还派遣督察室上校科长周镐、报务员陈士达、译电员李连青，携带一架电台，随程克祥一同来到南京。陈士达、李连青由周佛海掩护，在南京架设起秘密电台，专门为周佛海联络重庆。
程克祥、彭寿在上海依靠周佛海的掩护，很快成立军统“京沪区”，程克祥任区长，彭寿为副区长，指挥上海、南京以及苏南地区军统潜伏人员。1944年，他们曾将日军发动湘、粤、桂作战的情报报告给重庆，其情报工作一直进行到抗战胜利。
军统的“爆炸暗杀”
抗战期间，国民党军统特务还对汪伪首脑实施了多起“爆炸暗杀”。1941年3月，军统派遣“忠义救国军”南京行动总队的处长兼督察室主任王愈、行动员朱培生潜入南京。二人乘日伪当局要员出面活动之时，在南京大戏院、丽都花园投掷炸弹，炸死、炸伤汉奸多人，使得日伪要员心惊胆战，多时不敢到公开场合活动。1943年1月，强一虎潜入南京。在1943年1月14日汪伪国民党在南京召开六届四中全会的开幕式当天，强一虎在南京市中心夫子庙贡院东街新亚舞厅汪伪特工的情报据点内制造了一起爆炸案，炸死一名汪伪特务，造成很大的影响。
