1999年阅兵出现的红旗-2乙和红旗-2甲又有不同，其引信战斗部进一步优化，提高杀伤概率；搜索雷达进行全面升级，增加抗干扰能力。另外增设大屏幕作战指挥图，以方便指挥员了解最新情况，添加动目标显示和敌我识别功能；其牵引底盘也进行了改进。该弹是目前我军唯一现役的红旗-2。