为了保障新增电子设备运转，提高机内环控标准，轰-6K尾炮塔取消后的空间增加辅助动力装置（APU），提供额外电源和气源。轰炸机的地面保障勤务远比战斗机要复杂，因此轰-6K增加APU后也将增强其自主保障能力，特别是有利于大机群的转场部署，这都是为了大载荷远程飞行精心考虑的。